九州旅客鉄道長崎線で、2024年度の乗降客数が掲載されている23駅を多い順に並べています。同じ駅で複数の路線がある場合、乗降客数は「一番中心に近い駅」の行にだけ載るため、この路線の一部の駅は表に出ないことがあります(出典の仕様)。

1. 1位 佐賀駅 24,568人 佐賀県 佐賀市
2. 2位 長崎駅 18,982人 長崎県 長崎市
3. 3位 諫早駅 10,254人 長崎県 諫早市
4. 4位 浦上駅 4,772人 長崎県 長崎市
5. 5位 新鳥栖駅 4,124人 佐賀県 鳥栖市
6. 6位 長与駅 3,542人 長崎県 西彼杵郡長与町
7. 7位 喜々津駅 3,390人 長崎県 諫早市
8. 8位 神埼駅 3,008人 佐賀県 神埼市
9. 9位 吉野ヶ里公園駅 2,670人 佐賀県 神埼郡吉野ヶ里町
10. 10位 西諫早駅 2,316人 長崎県 諫早市
11. 11位 道ノ尾駅 2,314人 長崎県 西彼杵郡長与町
12. 12位 江北駅 2,238人 佐賀県 杵島郡江北町
13. 13位 中原駅 2,136人 佐賀県 三養基郡みやき町
14. 14位 西浦上駅 1,764人 長崎県 長崎市
15. 15位 肥前鹿島駅 1,760人 佐賀県 鹿島市
16. 16位 現川駅 1,474人 長崎県 長崎市
17. 17位 牛津駅 1,316人 佐賀県 小城市
18. 18位 肥前白石駅 1,254人 佐賀県 杵島郡白石町
19. 19位 久保田駅 1,224人 佐賀県 佐賀市
20. 20位 高田駅 1,196人 長崎県 西彼杵郡長与町
21. 21位 肥前麓駅 1,162人 佐賀県 鳥栖市
22. 22位 鍋島駅 1,138人 佐賀県 佐賀市
23. 23位 肥前古賀駅 678人 長崎県 長崎市