長崎県諫早市にある駅のうち、2024年度の乗降客数が掲載されている11駅を、乗降客数の多い順に並べています。数値は各駅で乗降客数が最も多い事業者・路線の行のものです。

1. 1位 諫早駅 10,254人 九州旅客鉄道 長崎線
2. 2位 喜々津駅 3,390人 九州旅客鉄道 長崎線
3. 3位 西諫早駅 2,316人 九州旅客鉄道 長崎線
4. 4位 諫早（雲仙・島原口）駅 1,727人 島原鉄道 島原鉄道線
5. 5位 本諫早（諫早市役所前）駅 956人 島原鉄道 島原鉄道線
6. 6位 幸駅 341人 島原鉄道 島原鉄道線
7. 7位 諫早東高校駅 193人 島原鉄道 島原鉄道線
8. 8位 小野駅 162人 島原鉄道 島原鉄道線
9. 9位 森山駅 108人 島原鉄道 島原鉄道線
10. 10位 干拓の里駅 94人 島原鉄道 島原鉄道線
11. 11位 釜ノ鼻駅 41人 島原鉄道 島原鉄道線

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